重点实验室
省部共建国家重点实验室
北京市脑重大疾病实验室
教育部重点实验室
神经变性病学实验室
耳鼻咽喉头颈科学实验室
儿科重大疾病研究实验室
心血管重塑相关疾病实验室
国家及北京市基地：
国家生命科学与技术人才培养基地
卫生部全科医学培训中心
北京市全科医学培训中心
首都卫生管理与政策研究基地
国家重点学科：
外科学（神外）
眼科学
耳鼻咽喉科学
神经生物学
内科学（呼吸系病）
内科学（心血管病）
神经病学
儿科学
国家重点培育学科：
内科学(消化系病)
影像医学与核医学
国家中医药管理局重点学科：
中西医结合基础
中医眼科学
中医心病学
中医脾胃病学
中医肿瘤病学
中医皮肤病学
针灸学
中医传染病学—培育学科
中医疮疡病学
中医急诊学
临床中药学
中医络病学—培育学科
中医传染病学—培育学科
中医神志病学—培育学科
国家临床医学研究中心：
心血管疾病临床研究中心
神经系统疾病临床研究中心
呼吸系统疾病临床研究中心
精神心理疾病临床研究中心
消化系统疾病临床研究中心
交叉学科北京市重点学科：
全科医学
一级学科北京市重点学科：
临床医学
生物医学工程
生物学
基础医学
二级学科北京市重点学科：
流行病与卫生统计学
口腔基础医学
口腔临床医学
药物化学
药理学
社会医学与卫生事业管理
一级学科北京市重点建设学科：
公共卫生与预防医学
中医学
二级学科北京市重点建设学科：
思想政治教育
应用心理学
中西医结合基础
中西医结合临床
药剂学
药物分析学
学科群：
在北京市教育委员会建设的10个学科群中，以我校为依托单位建设的学科群有1个：临床医学—神经科学。它由神经生物学、神经生理学、神经药理学、神经外科学、神经病学、疼痛医学、精神病学、麻醉学、医学影像学等9个学科组成。
师资力量
学校和附属医院现有教职员工和医务人员37795人（校本部1550人，附属医院36245人）。有院士6人，特聘顾问11人，正高职称1974人，副高职称3380人。其中教授738人（校本部101人，附属医院637人）,副教授1245人（校本部228人，附属医院1017人）；博士生导师439人（校本部83人，附属医院356人），硕士生导师839人（校本部143人，附属医院696人）。
