2001年5月
深圳市政府与哈尔滨工业大学签订市校合作办学协议，建设“哈尔滨工业大学深圳研究生院”。
2002年2月
教育部批准设立“哈尔滨工业大学深圳研究生院”，进驻深圳大学城。
2009年12月
市校签署合作备忘录，首次提出开展本科教育。
2014年
市校签署办学协议共建哈工大（深圳）
2014年5月
教育部批准哈尔滨工业大学深圳研究生院筹备举办本科教育。深圳市政府与哈尔滨工业大学签署新的合作办学协议，在哈尔滨工业大学深圳研究生院基础上，筹备共建本硕博教育体系完备
2015年7月
哈尔滨工业大学与深圳市政府、苏黎世艺术大学、加泰罗尼亚高等建筑研究院签署四方合作协议，依托深圳研究生院共建“哈尔滨工业大学（深圳）国际设计学院”。
2015年9月
哈尔滨工业大学（深圳）筹建办公室及临时党委相继设立。
2016年
哈尔滨工业大学（深圳）依托哈尔滨工业大学本部招收第一届本科生。
2017年
哈尔滨工业大学（深圳）空间科学与应用技术研究院成立。2017年7月，教育部致函工业和信息化部及广东省人民政府：经研究，以哈尔滨工业大学深圳研究生院为基础，
2018年
哈尔滨工业大学（深圳）将以独立招生代码招收本科生。
2018年11月
入选广东省新一轮高水平大学建设计划中的“高水平大学重点学科建设高校”。
2019年7月
入选中国高校行星科学联盟。
2019年12月
哈尔滨工业大学深圳校区被授予中国建设工程鲁班奖
