作为第一批试点高校，医学院全面实施“市属高校本科教学教师激励计划”，并按照“团队牵引、首席负责、全程激励、制度保障”的工作原则，在院本部组建了34个教育教学团队，医学教育质量得到进一步提升。

医学院作为教育部基础医学类教学指导委员会主任委员单位、教育部口腔医学类教学指导委员会副主任委员单位、国家级临床技能实验示范中心学科组长单位及国家级虚拟仿真实验教学中心，具有临床模拟功能齐备、师资团队雄厚、医疗资源丰富、操作平台先进的基地优势，并通过器官系统整合式课程、临床技能操作、客观化临床考试等全面提升医学生临床技能和创新意识。现拥有国家大学生校外实践教育基地4个，国家级临床技能实验教学培训示范中心1个，国家级虚拟仿真实验教学中心1个，国家临床教学培训示范中心2个，国家虚拟仿真实验教学项目2项。

历年来，共获得国家级教学成果奖11项，国家级一流本科专业建设点7个，国家级精品课程10门，国家级资源共享课程5门，国家级双语教学示范课程3门，国家精品在线开放课程2门，国家级精品公开示范课8门，国家级一流本科课程6门。《常见慢性病的健康管理》成为国内首门护理专业的大型开放式网络课程（MOOC）。

图书馆总藏书量近100万册（其中电子图书50余万册），是国内重点收藏单位，也是全国法文医学特藏中心。电子文献数据库86个，覆盖临床医学、基础医学、药学、护理学、公共卫生及循证医学等生物医学各领域。此外，图书馆还拥有Primal Pictures、Access Medicine系列等丰富的医学教学科研资源。

医学院率先探索和实践临床医学专业“5+3”及“5+3+X”改革。深度参与上海市住院医师规范化培训工作，积极推进住院医师规范化培训与临床医学硕士专业学位教育有效衔接，率先试点开展与专科医师规范化培训相结合的临床医学博士专业学位研究生的培养工作。2021年，新招录住院医师1141名，专科医师规范化培训生483名，分别占全市招录总人数的35%和43%。